1. Chủ tịch Ủy ban nhân dân các tỉnh nằm trong lưu vực sông Mê Công, Bộ trưởng, Thủ trưởng các cơ quan ngang Bộ có liên quan đến các họat động của Ủy hội sông Mê Công phải trực tiếp nghiên cứu, nắm vững nội dung và chỉ đạo thực hiện nghiêm túc Hiệp định Mê Công, đặc biệt là Điều 5 về sử dụng nước hệ thống sông Mê Công một cách hợp lý và công bằng; Điều 7 về ngăn ngừa và giảm tới mức thấp nhất những ảnh hưởng có hại đối với chất lượng và số lượng nước, các điều kiện thủy sinh thái và cân bằng sinh thái của hệ thống sông Mê Công; Điều 8 về trách nhiệm quốc gia đối với thiệt hại; và Điều 9 về tự do giao thông thủy trên dòng chính sông Mê Công.
2. Cán bộ các Bộ, Ngành và địa phương khi đi dự các cuộc họp quốc tế có nội dung liên quan đến hợp tác Ủy hội sông Mê Công phải liên hệ với Ủy ban sông Mê Công Việt Nam để nắm được nội dung Hiệp định Mê Công, các chủ trương của Chính phủ về hợp tác Ủy hội sông Mê Công.
3. Ủy ban sông Mê Công Việt Nam: - Phổ biến và hướng dẫn các bộ, ngành và địa phương liên quan quán triệt và thực hiện đúng đắn Hiệp định Mê Công. - Thu thập, tổng hợp tất cả các vấn đề có liên quan đến việc thực hiện các nội dung của Hiệp định Mê Công. - Làm việc với Ủy hội sông Mê Công về các vấn đề liên quan đến tinh thần Quyết định số 860/TTg ngày 30/12/1995 của Thủ tướng Chính phủ về chức năng nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức bộ máy của Ủy ban sông Mê Công ViệtNam. - Định kỳ báo cáo Thủ tướng Chính phủ các nội dung có liên quan đến việc thực hiện Hiệp định Mê Công. Việc thực hiện Hiệp định hợp tác phát triển bền vững lưu vực sông Mê Công là nhiệm vụ bức thiết và quan trọng. Ủy ban sông Mê Công Việt Nam phối hợp với các địa phương trong lưu vực sông Mê Công, các Bộ, ngành có liên quan khẩn trương thực hiện tốt Chỉ thị này. THỦ TƯỚNG (Đã ký) Võ Văn Kiệt